H στρατηγική στοχοθεσία που καλείται να υποστηρίξει το Κέντρο Καινοτομίας & Επιχειρηματικότητας του Ιονίου Πανεπιστημίου είναι η δημιουργία ενός περιφερειακού οικοσυστήματος, μέσα στο οποίο μέλη της ακαδημαϊκής κοινότητας και πόροι του πανεπιστημίου θα αναπτύσσουν συνέργειες με πρόσωπα και πόρους εκτός του Ιδρύματος, προκειμένου να προωθείται η ανάπτυξη και διάχυση της έρευνας και της γνώσης.